Каждый орган человеческого организма обладает собственной микробиотой, и глаз, сложный многокомпонентный орган, не является исключением. За счет ограничения традиционных методов исследования подробное изучение микробиома (МБ) глаза началось только в 2010 г. в рамках проекта «Глазной микробиом», когда благодаря прогрессу методов изучения удалось получить подробные данные, хотя ранее возникали споры, способны ли вообще микроорганизмы прикрепляться к поверхности глаза – слоям слезной пленки, обладающей антибактериальными свойствами. Структуры поверхности глаза формируют роговица, конъюнктива, слезные железы и слезная пленка, мейбомиевы железы, которые дополняются за счет МБ; вместе они противостоят раздражителям, аллергенам и патогенам. Для сохранения здоровья органа зрения критически важен гомеостаз микробиоты глаза. Большинство микроорганизмов располагаются на роговице и конъюнктиве, и современные методы исследования, в том числе секвенирование 16S рРНК, позволили установить «ядро» микробиоты поверхности глаза, выделив наиболее распространенные типы: Staphylococcus, Corynebacterium, Propionibacterium и Streptococcus, хотя вопрос точного состава «ядра» остается дискутабельным. На состав МБ способны оказывать влияние многие факторы, в числе которых возраст, ношение контактных линз, прием офтальмологических препаратов и антибиотиков. Как и на МБ многих других органов, на МБ поверхности глаза оказывает влияние МБ кишечника: данная связь названа осью «микробиота – кишечник – глаз». В рамках оси «кишечник – глаз» здоровая микробиота кишечника производит короткоцепочечные жирные кислоты, индолы, полиамины и другие вещества, благотворно воздействующие на иммунную систему и здоровье сетчатки глаза. Состояние дисбиоза может приводить к нарушению гомеостаза, а нарастающая воспалительная реакция – способствовать повреждению зрительного нерва и прогрессированию заболевания глаз. Некоторые офтальмологические заболевания, например диабетическая ретинопатия, возрастная макулярная дегенерация, хориоидальная неоваскуляризация, увеит, первичная открытоугольная глаукома, синдром Шёгрена, синдром сухого глаза, вероятно, связаны с изменением микробного состава кишечника. Коррекция дисбиоза кишечника с применением различных методов приводит к снижению риска развития заболеваний глаз, хотя требуются дополнительные исследования для обнаружения новых методов лечения офтальмологических патологий по оси «микробиота – кишечник – глаз».